La concentrazione della clorofilla “a” nelle acque mette in evidenza il livello di eutrofizzazione delle acque costiere. E’ di fondamentale importanza per l’applicazione di indici trofici e dell’indice di torbidità, per la valutazione delle caratteristiche trofiche del corpo idrico e dello stato degli ecosistemi; inoltre è un ottimo indicatore per la valutazione della produzione primaria e dei gradi di trofia dell’ecosistema.